Dolores Van Cartier (Whoopi Goldberg) est une chanteuse peu connue dans un cabaret de Reno. Son petit ami, Vince LaRocca, fait abattre un homme sous ses yeux. Choquée, elle se rend à la police où elle découvre qu'il est déjà connu par leurs services. Pour la protéger, le lieutenant Eddie Souther la cache dans un couvent de San Francisco, la déguisant en religieuse. Delores va avoir quelques problèmes à s'intégrer et à plaire à la mère supérieure (Maggie Smith). Celle-ci n'assigne Dolores qu'à une seule et unique tâche : s'occuper de la chorale, qui reprend des musiques des années 1960 à l'origine des chants religieux. Dolores va alors donner un nouvel élan à l'établissement religieux, invitant notamment les bonnes sœurs à une ré-orchestration musicale de leurs chants, pour finir sur un concert de gospel.
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